Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFT2D3Q587I9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms