Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms