Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SBK1Q52WX2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SBK1Q52WX2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms