Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRNQ4KMQ1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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