Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00303Q3SY05 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms