Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TTLL9Q3SXZ7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms