Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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GEN1Q17RS7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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GEN1Q17RS7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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GEN1Q17RS7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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GEN1Q17RS7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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GEN1Q17RS7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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GEN1Q17RS7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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GEN1Q17RS7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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GEN1Q17RS7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GEN1Q17RS7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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GEN1Q17RS7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GEN1Q17RS7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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