Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms