Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NRF1Q16656 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms