Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNHIT3Q15649 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNHIT3Q15649 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms