Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDCD1Q15116 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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