Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HERC3Q15034 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERC3Q15034 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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