Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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RAB39AQ14964 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB39AQ14964 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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