Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CTTNQ14247 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CTTNQ14247 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms