Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RUNX2Q13950 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms