Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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