Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAMK2DQ13557 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAMK2DQ13557 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms