Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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