Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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