Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRAF1Q13077 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms