Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NFX1Q12986 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms