Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KCNA1Q09470 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KCNA1Q09470 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms