Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDE4BQ07343 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms