Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TOP2BQ02880 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms