Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms