Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTBSQ01459 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms