Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIM1P81133 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SIM1P81133 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIM1P81133 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIM1P81133 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIM1P81133 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIM1P81133 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIM1P81133 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIM1P81133 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms