Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL8P80075 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL8P80075 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL8P80075 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms