Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms