Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SPCS3P61009 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SPCS3P61009 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms