Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NME5P56597 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NME5P56597 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NME5P56597 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NME5P56597 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms