Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC4P56524 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC4P56524 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms