Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXG1P55316 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms