Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms