Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKX2-5P52952 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKX2-5P52952 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms