Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HK3P52790 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HK3P52790 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HK3P52790 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HK3P52790 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms