Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP5P51878 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CASP5P51878 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CASP5P51878 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CASP5P51878 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CASP5P51878 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms