Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DAP3P51398 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DAP3P51398 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DAP3P51398 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms