Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
XCR1P46094 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
XCR1P46094 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
XCR1P46094 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
XCR1P46094 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms