Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHKA1P46020 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHKA1P46020 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms