Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC1P41238 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC1P41238 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms