Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ARL1P40616 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL1P40616 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL1P40616 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL1P40616 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL1P40616 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL1P40616 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ARL1P40616 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ARL1P40616 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms