Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNCAP37840 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNCAP37840 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNCAP37840 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNCAP37840 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNCAP37840 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNCAP37840 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNCAP37840 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNCAP37840 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNCAP37840 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms