Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXA6P31267 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA6P31267 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HOXA6P31267 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA6P31267 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA6P31267 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA6P31267 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA6P31267 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXA6P31267 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms