Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND1P24385 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND1P24385 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND1P24385 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND1P24385 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND1P24385 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND1P24385 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms