Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPREP23469 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPREP23469 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPREP23469 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPREP23469 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPREP23469 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPREP23469 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPREP23469 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPREP23469 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPREP23469 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPREP23469 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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