Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCL1P22362 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCL1P22362 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL1P22362 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL1P22362 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCL1P22362 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms