Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms