Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDCP20941 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCP20941 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDCP20941 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDCP20941 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDCP20941 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCP20941 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCP20941 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCP20941 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCP20941 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms