Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCC1P18754 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms